Fiersviridae

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Fiersviridae

Kapsid des Bakteriophagen MS2

Systematik
Klassifikation: Viren
Realm: Riboviria[3]
Reich: Orthornavirae[2]
Phylum: Lenarviricota[2]
Klasse: Leviviricetes[1]
Ordnung: Norzivirales[1]
Familie: Fiersviridae
Taxonomische Merkmale
Genom: (+)ssRNA linear
Baltimore: Gruppe 4
Symmetrie: ikosaedrisch
Wissenschaftlicher Name
Fiersviridae
Links
NCBI Taxonomy: 11989
ViralZone (Expasy, SIB): 163
ICTV Taxon History: 201903751

Die Fiersviridae (veraltet: Leviviridae) sind eine Familie von Viren, die als Bakteriophagen verschiedene Bakterien, einschließlich Enterobakterien, Caulobacter, Pseudomonas und Acinetobacter befallen. Die Taxonomie des International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) mit Stand November 2018 kennt zwei Gattungen zu je zwei Spezis.[4][5]

Es handelt sich um kleine RNA-Viren mit linearem, einzelsträngigem RNA-Genom positiver Polarität, die nur vier Proteine kodieren. Alle Phagen dieser Familie benötigen bakterielle Pili, um sich an die Wirtszelle (Bakterienzelle) zu binden und diese zu infizieren.[6]

Im März 2021 wurde vorgeschlagen, diese Viren aus der bisherigen Klasse Allassoviricetes in eine neue Klasse Leviviricetes zu verschieben.[7] Dem hat das ICTV in der Ausgabe 36 seiner Master Species List (MSL) 2021 entsprochen, und dabei gleichzeitig die Ordnung (von Levivirales zu Norzivirales) und die Familie (von Leviviridae zu Fersviridae) umbenannt. Gleichzeitig hat sich die Anzahl der Gattungen von zwei auf 185 erhöht.[1]

Systematik

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Äußere Systematik

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Die Familie ist Mitglied der Ordnung Norzivirales (früher Levivirales). Die meisten Vertreter dieser Ordnung wurden per Metagenomik gefunden.[8] Zu dieser gehören die folgenden Familien:[1]

Innere Systematik

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Die Familie hat mit ICTV Stand 7. Mai 2024 dreihundertacht (308) Gattungen (Genera). Diese sind – mit einer Auswahl an Arten (Spezies):[9][10]

  • Familie Fiersviridae (veraltet Leviviridae)
  1. Genus Amubhivirus
  2. Genus Andhasavirus
  3. Genus Andhaxevirus
  4. Genus Ashucavirus
  5. Genus Bahscuvirus
  6. Genus Behevivirus
  7. Genus Behlfluvirus
  8. Genus Bihdovirus
  9. Genus Bisdanovirus
  10. Genus Blafavirus
  11. Genus Bohnovirus
  12. Genus Bohwovirus
  13. Genus Boschuvirus
  14. Genus Breudwovirus
  15. Genus Buhdavirus
  16. Genus Cahdavirus
  17. Genus Cahrpivirus
  18. Genus Caloevirus
  19. Genus Cauhldivirus
  20. Genus Cehakivirus
  21. Genus Chaedoavirus
  22. Genus Chahsmivirus
  23. Genus Chihyovirus
  24. Genus Chobevirus
  25. Genus Choctavirus
  26. Genus Cintrevirus
  27. Genus Cunavirus
  28. Genus Dahmuvirus
  29. Genus Darnbovirus
  30. Genus Decadevirus
  31. Genus Denfovirus
  32. Genus Depandovirus
  33. Genus Dihsdivirus
  34. Genus Dohlivirus
  35. Genus Dortuvirus mit ehem. Creshivirus fonticola
  36. Genus Dorudgevirus
  37. Genus Dosmizivirus
  38. Genus Draycavirus
  39. Genus Dreytovirus
  40. Genus Duhcivirus
  41. Genus Dunchevirus
  42. Genus Dursuvirus inkl. ehem. Genus Apukhovirus
  43. Genus Eahsevirus
  44. Genus Eahvevirus
  45. Genus Eedhovirus
  46. Genus Eerlswovirus
  47. Genus Eistcuvirus
  48. Genus Emesvirus (früher Levivirus)[11]
  49. Genus Empivirus
  50. Genus Etongtovirus
  51. Genus Fagihyuvirus
  52. Genus Fenycovirus
  53. Genus Fihluvirus
  54. Genus Firnpuvirus
  55. Genus Fiyodovirus
  56. Genus Flehknovirus
  57. Genus Frinctavirus
  58. Genus Fulbrouvirus
  59. Genus Gahlovirus
  60. Genus Galoycavirus
  61. Genus Garovuvirus
  62. Genus Gehnevirus
  63. Genus Giydovirus
  64. Genus Glyciruvirus
  65. Genus Gmuhndevirus
  66. Genus Gorodievirus
  67. Genus Grandpovirus
  68. Genus Greatevirus
  69. Genus Greatpavirus
  70. Genus Grehavirus
  71. Genus Grendovirus
  72. Genus Grendvuvirus
  73. Genus Gunawavirus
  74. Genus Haeldovirus
  75. Genus Hagavirus
  76. Genus Hahdsevirus
  77. Genus Hahmbtovirus
  78. Genus Hahsevirus
  79. Genus Halcalevirus
  80. Genus Hampdavirus
  81. Genus Hamptovirus
  82. Genus Helfovirus
  83. Genus Herbuvirus
  84. Genus Hihdivirus
  85. Genus Hihlwaovirus
  86. Genus Hirbarovirus
  87. Genus Hirtshivirus
  88. Genus Hisilivirus
  89. Genus Hisilovirus
  90. Genus Hitdovirus
  91. Genus Hohnivirus
  92. Genus Honleyivirus
  93. Genus Honolovirus
  94. Genus Hudnivirus
  95. Genus Huhnivirus
  96. Genus Huhnuvirus
  97. Genus Hukohnovirus
  98. Genus Hurlivirus
  99. Genus Icumivirus
  100. Genus Ideskevirus
  101. Genus Idlucavirus
  102. Genus Imeberivirus
  103. Genus Ineyimevirus
  104. Genus Iruqauvirus
  105. Genus Ishugivirus
  106. Genus Jiesduavirus
  107. Genus Johnovirus
  108. Genus Jupbevirus
  109. Genus Kahfsdivirus
  110. Genus Keghovirus
  111. Genus Kehmevirus (inkl. ehem. Genus Aldhiuvirus)
  112. Genus Kehrevirus
  113. Genus Kemicevirus
  114. Genus Kihryuvirus
  115. Genus Kinehtovirus
  116. Genus Kinolwovirus
  117. Genus Kirnavirus
  118. Genus Kiwsmaevirus
  119. Genus Kongskuvirus
  120. Genus Konkivirus
  121. Genus Konwavirus
  122. Genus Koteshevirus inkl. ehem. Brudgevirus terrivivens (jetzt Koteshevirus terrivivens), ehem. Condavirus edaphovicinum, ehem. Condavirus edaphohabitans
  123. Genus Kowinovirus
  124. Genus Kuhshuvirus
  125. Genus Kungsnevirus
  126. Genus Kungspuvirus
  127. Genus Lahbwuvirus
  128. Genus Lahdbrovirus
  129. Genus Langlevirus
  130. Genus Leahmovirus
  131. Genus Lecwavirus
  132. Genus Lehamuvirus
  133. Genus Lighthovirus
  134. Genus Lihdtlovirus
  135. Genus Lihtdlivirus mit ehem. Condavirus edaphenecus
  136. Genus Litdlevirus
  137. Genus Loamavirus
  138. Genus Loghdhuvirus
  139. Genus Lohmavirus
  140. Genus Lohngkovirus inkl. Teile von ehem. Genus Brudgevirus
  141. Genus Lohwevirus
  142. Genus Lohwovirus
  143. Genus Longmavirus
  144. Genus Longovirus
  145. Genus Loslovirus
  146. Genus Lowerquvirus
  147. Genus Lowsuvirus
  148. Genus Loxlovirus
  149. Genus Ludtlevirus
  150. Genus Ludtlovirus
  151. Genus Ludtovirus
  152. Genus Lunjlavirus
  153. Genus Luthavirus inkl. ehem. Genus Bathrivirus
  154. Genus Lyejrivirus
  155. Genus Mahqeavirus
  156. Genus Mahraivirus
  157. Genus Manrohovirus
  158. Genus Mahrtovirus
  159. Genus Manrohovirus
  160. Genus Martavirus
  161. Genus Martovirus
  162. Genus Maxstovirus
  163. Genus Meblowovirus
  164. Genus Mehraxmevirus
  165. Genus Mehrevirus
  166. Genus Mekintivirus
  167. Genus Merlkluvirus
  168. Genus Methovirus
  169. Genus Mihkrovirus inkl. ehem. Genus Bertavirus
  170. Genus Mincetevirus
  171. Genus Mintuvirus
  172. Genus Mohredovirus
  173. Genus Molcatevirus
  174. Genus Molvevirus
  175. Genus Monkskivirus
  176. Genus Moxhuvirus
  177. Genus Mutledovirus
  178. Genus Muyegivirus
  179. Genus Nadsecevirus
  180. Genus Napdanuvirus
  181. Genus Nedhivirus
  182. Genus Nehwtovirus
  183. Genus Newbovirus
  184. Genus Newpuvirus
  185. Genus Niankuvirus
  186. Genus Niuhvovirus
  187. Genus Niwnhavirus
  188. Genus Niwtovirus
  189. Genus Nohmivirus
  190. Genus Nohrdovirus
  191. Genus Northevirus
  192. Genus Oceshuvirus
  193. Genus Oldperovirus
  194. Genus Olmsdivirus
  195. Genus Omohevirus
  196. Genus Onohmuvirus
  197. Genus Opdykovirus
  198. Genus Overwhuvirus
  199. Genus Owenocuvirus
  200. Genus Oxychlovirus
  201. Genus Pailtovirus
  202. Genus Paloswovirus
  203. Genus Palsdevirus
  204. Genus Paysduvirus
  205. Genus Pedhlovirus
  206. Genus Pehohrivirus
  207. Genus Pehsaduvirus
  208. Genus Pepevirus
    • Spezies Pepevirus rubrum (mit Pseudomonas phage PP7)[12]
    • …
  209. Genus Perrunavirus
  210. Genus Philtcovirus
  211. Genus Phobpsivirus
  212. Genus Piceduvirus
  213. Genus Pihlevirus
  214. Genus Pilordavirus
  215. Genus Piponevirus
  216. Genus Pohlevirus
  217. Genus Poncivirus
  218. Genus Prihavirus
  219. Genus Prihovirus
  220. Genus Prisdovirus
  221. Genus Prosdovirus
  222. Genus Pruncivirus
  223. Genus Psimevirus
  224. Genus Pudlivirus
  225. Genus Punlevirus
  226. Genus Qubevirus (früher Allolevivirus)[13]
    • Spezies Qubevirus durum (mit Escherichia virus Qbeta alias Enterobakteriophage Qbeta, Coliphage Qβ)
    • Spezies Qubevirus escherichienecus (mit Escherichia virus Qbeta 1)
    • Spezies Qubevirus faecium (mit Escherichia virus FI)
  227. Genus Quihndavirus
  228. Genus Radbaivirus
  229. Genus Rahdfavirus
  230. Genus Ratlevirus
  231. Genus Redbauvirus
  232. Genus Rehihmevirus
  233. Genus Rehudzovirus
  234. Genus Ridwavirus
  235. Genus Rusvolovirus
  236. Genus Rytunovirus
  237. Genus Sahwbrivirus
  238. Genus Sambuevirus
  239. Genus Saudhavirus
  240. Genus Sbehrnivirus
  241. Genus Scuadavirus
  242. Genus Sdadlevirus
  243. Genus Sdoctuvirus
  244. Genus Sdohnivirus
  245. Genus Sdredfovirus
  246. Genus Sdredtuvirus
  247. Genus Sdretovirus
  248. Genus Seckivirus
  249. Genus Sehpovirus
  250. Genus Selfuvirus
  251. Genus Seybrovirus
  252. Genus Shebanavirus
  253. Genus Shehrpovirus
  254. Genus Shestuvirus
  255. Genus Shihovirus
  256. Genus Shipsduvirus
  257. Genus Shodtevirus
  258. Genus Sholavirus
  259. Genus Shomudavirus
  260. Genus Shrewlivirus
  261. Genus Shuldovirus
  262. Genus Shutevirus
  263. Genus Shutovirus
  264. Genus Sincthavirus
  265. Genus Skhembuvirus
  266. Genus Smudhfivirus
  267. Genus Snitdevirus
  268. Genus Soetuvirus
  269. Genus Stanolovirus
  270. Genus Stehlmavirus
  271. Genus Sterodovirus
  272. Genus Stoartovirus
  273. Genus Stretavirus
  274. Genus Stritovirus
  275. Genus Suhtovirus
  276. Genus Swihdzovirus
  277. Genus Tahluvirus
  278. Genus Tapikevirus
  279. Genus Teciucevirus
  280. Genus Tehnexuvirus
  281. Genus Temblevirus
  282. Genus Templevirus
  283. Genus Templovirus
  284. Genus Tenwovirus mit ehem. Creshivirus pelohabitans
  285. Genus Thiwvovirus
  286. Genus Thiyevirus
  287. Genus Thobivirus
  288. Genus Thurlavirus
  289. Genus Ticahravirus
  290. Genus Todtivirus
  291. Genus Tohvovirus
  292. Genus Trotivirus
  293. Genus Trucevirus
  294. Genus Tudmivirus
  295. Genus Tysohivirus
  296. Genus Ulinhavirus
  297. Genus Upborqevirus (inkl. ehem. Genus Boloprevirus)
  298. Genus Ureyisuvirus
  299. Genus Ushumevirus
  300. Genus Vohsuavirus
  301. Genus Whietlevirus
  302. Genus Whilavirus
  303. Genus Wohudhevirus
  304. Genus Wyahnevirus
  305. Genus Yahnavirus (inkl. ehem. Genus Adahivirus)
  306. Genus Yemegivirus
  307. Genus Yohcadevirus
  308. Genus Yuhrihovirus

Bei Reorganisationen wurden beispielsweise verschoben:

  1. Genus Condavirus aufgeteilt Koteshevirus + Lihtdlivirus
  2. Genus Creshivirus aufgeteilt Dortuvirus + Tenwovirus

Aufbau

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Schemazeichnung eines Virusteilchens der Leviviridae (Querschnitt) und Genom von
(a) Enterobacteriaphage MS2 (Gattung Levivirus)
(b) Enterobacteriaphage Qß (Gattung Allolevivirus)

Die Viruspartikel (Virionen) der Leviviridae sind nicht umhüllt mit ikosaedrischer oder sphärischer Geometri und mit Triangulationszahl (Symmetrie) T=3. Der Durchmesser beträgt etwa 26 nm. Das Genom ist linear und nicht segmentiert mit einer Größe von etwa 4000 Nukleotidbasen. Es kodiert für 4 Proteine.[4]

Wirkungsweise

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Replikationszyklus der Leviviridae

Nach Eintritt die Wirtszelle erfolgt die Replikation dem Modell für RNA-Viren positiver Polarität. Das Virus tritt durch Bakterienlyse aus der Wirtszelle aus.[4]

Die vier kodierten Proteine sind das Mantel- oder Hüllprotein (für das Kapsid), die Replikase, das Reifungsprotein (A-Protein) und das Lyse-Protein, die zugehörigen Gene heißen cp, rep, mat und lys.[6]

Einzelnachweise

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  1. ↑ a b c d ICTV: ICTV Master Species List 2020.v1, New MSL including all taxa updates since the 2019 release, March 2021 (MSL #36)
  2. ↑ a b ICTV: ICTV Master Species List 2019.v1, New MSL including all taxa updates since the 2018b release, March 2020 (MSL #35)
  3. ↑ ICTV Master Species List 2018b v1 MSL #34, Feb. 2019
  4. ↑ a b c ViralZone – Fiersviridae. ExPASy, abgerufen am 19. Dezember 2018 (englisch).
  5. ↑ ICTV: ICTV Master Species List 2018a v1. Archiviert vom Original am 14. März 2019; abgerufen am 19. Dezember 2018 (englisch).  Info: Der Archivlink wurde automatisch eingesetzt und noch nicht geprüft. Bitte prüfe Original- und Archivlink gemäß Anleitung und entferne dann diesen Hinweis.@1@2Vorlage:Webachiv/IABot/talk.ictvonline.org
  6. ↑ a b JP Bollback, JP Huelsenbeck: Phylogeny, genome evolution, and host specificity of single-stranded RNA bacteriophage (family Leviviridae). In: Journal of Molecular Evolution. 52. Jahrgang, Nr. 2, Februar 2001, S. 117–28, doi:10.1007/s002390010140, PMID 11231891 (englisch).
  7. ↑ Dann Turner, Andrew M. Kropinski, Evelien M. Adriaenssens: A Roadmap for Genome-Based Phage Taxonomy, in: MDPI Viruses Band 13, Nr. 3, Section Bacterial Viruses, 18. März 2021, 506, doi:10.3390/v13030506
  8. ↑ J. Callanan, S. R. Stockdale, E. M. Adriaenssens, J. H. Kuhn: Rename one class (Leviviricetes - formerly Allassoviricetes), rename one order (Norzivirales - formerly Levivirales), create one new order (Timlovirales), and expand the class to a total of six families, 420 genera and 883 species. In: Researchgate. Januar 2021, doi:10.13140/RG.2.2.25363.40481 (englisch, researchgate.net).
  9. ↑ ICTV: Taxonomy Browser.
  10. ↑ ICTV: Virus Metadata Resource (VMR).
  11. ↑ SIB: Levivirus, auf: ViralZone
  12. ↑ Jirapat Thongchol, Zihao Yu, Laith Harb, Yiruo Lin, Matthias Koch, Matthew Theodore, Utkarsh Narsaria, Joshua Shaevitz, Zemer Gitai, Yinghao Wu, Junjie Zhang, Lanying Zeng: Removal of Pseudomonas type IV pili by a small RNA virus. In: Science, Band 384, Nr. 6691, 5. April 2024; doi:10.1126/science.adl0635 (englisch). Dazu:
  13. ↑ SIB: Allolevivirus, auf: ViralZone
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